Ho segnalato a #tophost che l'interfaccia phpmyadmin aveva problemi di timeout. Il loro tecnico ha preso in consegna il ticket alle 12.59.53 e dopo 3 ore (15.59.52) mi ha rispost:
Le consigliamo di installare nel suo spazio web un client MySQL più "leggero" rispetto a phpMyAdmin: http://www.adminer.org/en/

Non ho veramente parole: ho aperto un nuovo ticket (il precedente l'avevano chiaramente chiuso) infamandoli!