Tecnicamente no ... tramite distiller e tramite programma. Il programma si appoggia alle librerie dell'ultima versione che ha quindi se ad esempio, usi illustrator 5 si appoggerà alle librerie del PDF che esisteva a quei tempi.

Distiller si appoggia alle ultime librerie della sua installazione, logicamente se hai installato la versione 5 il risultato sarà lo stesso.

Non dovresti avere problemi sulla stampa ma sulle opzioni che userai ...

perchè?